常染色体STR：
短串联重复序列（STR）是广泛存在于人类基因组中的一类具有长度多态性的DNA序列。它由2～6个碱基对构成核心序列，呈串联重复排列，其长度多态性主要由核心序列拷贝数目的变化而产生。一般认为，人类基因组平均每6～10kb就有1个STR基因座，为法医个人识别和亲子鉴定提供了高信息基因座的丰富来源。与限制性片段长度多态性产生的DNA指纹相比，用聚合酶链反应技术（PCR）扩增STR基因座产生的DNA纹印具有更高的灵敏度。STR扩增片段较短（100～300bp），对于常见含部分降解DNA的陈旧斑痕，PCR扩增STR比DNA指纹分析更容易成功。
性染色体STR：
人类Y染色体属于近端着丝粒染色体，由长臂Yq和微小的短臂Yp组成，DNA长度约60Mb。
Y-DNA中大致有五类多态性遗传标记：卫星DNA、小卫星DNA、微卫星DNA、插入或缺失及SNP。Y染色体STR基因座（Y-STR）是其中一种重要的遗传标记。
与常染色体STR基因座相比，大多数Y-STR基因座具有复杂的串联重复结构：
一个基因座内常含有两种以上不同的重复单位，恒定重复序列和可变重复序列同时存在。与常染色体STR基因座比较，
Y-STR分型的法医学应用具有以下特点：
①Y染色体为男性所特有，
②Y-STR呈父系遗传特征，只能有父亲传递给儿子，
③在减数分裂过程中，Y-特异性区不发生重组，
④评估Y-STR鉴别能力的指标是遗传差异度，
⑤和mtDNA一样，Y-STR分型结果不具有唯一性，其法医学应用价值在于排除，而不能认定。
X-STR基因座具有伴性遗传的特征，X-STR的遗传特征既不同于常染色体，也不同于Y染色体，表现为性连锁特征。
进行分型检测时，男性个体X-STR显现一条片段，女性杂合子则显示两条等位基因片段。
