和同容量普通变压器相比，自耦变压器有以下主要特点：
（1）由于自耦变压器的计算容量小于额定容量，所以在同样的额定容量下，自耦变压器的主要尺寸较小，有效材料（硅钢片和导线）和结构材料（钢材）都相应减少，从而降低了成本。有效材料的减少使得铜耗和铁耗也相应的减少，故自耦变压器的效率极高。同时由于主要尺寸的缩小和质量的减小，可以在容许的运输条件下制造单台容量更大的变压器。但通常在自耦变压器中只有k2时，上述优点才明显。
（2）由于自耦变压器的短路阻抗标幺值比双绕组变压器小，故电压变化率较小，但短路电流较大。
（3）由于自耦变压器一、二次之间有电的直接联系，当高电压侧过电压时会引起低电压侧严重过电压。为了避免这种危险，一、二次都必须装设避雷器。不要认为一、二次绕组是串联的，一次以装、二次就可省略。
（4）在一般变压器中，有载调压装置往往连接在接地的中性点上，这样调压装置的电压等级可以比在线端调压时低。而自耦变压器中性点调压侧会带来所谓的相关调压问题。因此，要求自耦变压器有载调压时，只能采用线端调压方式。
