1、从申诉与控告的目的来看，申诉的目的是使处理机关改变或撤销对自己的处理规定，以便恢复自己的合法权益，并使已经受到的损失得到补偿；控告的目的则不仅是使自己的合法权益得到恢复和补偿，而且还要求有关机关追究实施不法侵害的机关或人员的法律责任。
2、从导致申诉、控告行为的原因上看，引起申诉的原因，是国家公务员对已发生效力的处理决定不服，要求重新审查处理；引起控告的原因，是国家公务员的合法权益受到不法侵害，要求对责任人进行惩处。
3、从申诉、控告的功能上看，申诉的重点是保护国家公务员个人的合法权益，及时纠正行政机关的不当处理；而控告的重点则是国家公务员对行政机关及其领导人的监督，以保证其执行政策和法律的准确性、严肃性。
