引起煤厚变化的地质因素：原生变化和后生变化。
常见的有：1）泥炭沼泽基底不平影响煤层形态和厚度的变化
①、煤层底版或基底岩层界面呈凹凸起伏而顶板界面却比较平整，即“顶平底不平”。
②、往往在含煤岩系的底部或下部的煤层煤厚变化极为不规则。
③、基底古地形低洼处煤层增厚，向突起部位尖灭变薄。其分层和层理多为下伏的基底岩层界面所截切，呈现超覆样式。
2）煤层形成时期的沉积环境对煤层的形态和煤层厚度有直接的关系。
①、沉积体系和煤层厚度、形态变化的关系。
②、对煤层分岔类型的影响。
3）同沉积构造对煤层形态和煤厚变化的影响聚煤盆地基底的不均衡沉降，如基底断块差异性沉陷、同沉积褶皱和断裂等，通过对沉积环境的控制，能够对煤层形态和煤层变化产生深刻的影响。
①、基底断裂系控制的煤层分带。
②、盆内次级同沉积褶皱对煤层形态和煤厚变化的影响。
③、盆内同沉积断裂活动对煤层形态和煤厚的影响。
4）泥炭堆积过程中或泥炭层被沉积物覆盖以后河流等对煤层的冲刷剥蚀。
5）后期构造变动引起煤厚变。
6）岩浆侵入。
7）岩溶陷落柱的影响。
含煤地层下伏岩系如果为可溶性岩石，如石灰岩、白云岩、石膏层等，在地下水的溶蚀作用下可以形成岩溶洞穴，随着洞穴规模的扩大，在上覆岩系的重力荷载下，煤层及其围岩逐渐跨落，可形成环形柱状陷落。
