常用的施药方法有：
①浸洗法。将鱼放在较高浓度的药物里，浸洗一定的时间，时间长短，随鱼体大小，体质强弱，药物浓度，水温高底等情况而定。一般浸洗时间为10—30分钟。如在浸洗液中加充氧器可以浸洗1小时。此法是鱼病预防的主要方法，转塘放鱼种，或从外地购回鱼种，都必须进行体表消毒。
②食场挂袋法。在食场的三角框内挂药物袋，使食场形成药物区，当鱼进入食场摄食时，通过药物区进行体表消毒。食场挂两种袋，一种漂白粉袋，每袋装药2两，每个食场挂3个袋，每天换1次，连挂3天，每半月一次，漂白粉主要杀灭体表细菌。第二种硫酸铜袋，每袋装2两，每个食场挂3个袋，药物每2天换1次，每半月进行一次。硫酸铜主要杀灭体表寄生虫，是鱼病预防的好方法，每年五月份鱼病季节，可以采用此方法，即可省药，又简便。但此法杀灭病原体不彻底。
③遍洒法。此法是鱼病防治上最常使用的方法。使用药物的浓度对鱼类是能忍受的安全浓度，又能治疗疾病。主要用来治疗体表疾病，此法方便简单，但使用药物较多，施药前必须测量水体，而且计算要比较准确。
④口服法。主治内脏疾病。此法是将药物与饲料充分混合，做成药饵可以用硬颗料饲料机，但不能用膨化机，因膨化机温度太高。膨化饲料做成药饵应首先做成饵料，再用喷雾器把药均匀洒到膨化饵料上。
另一种是农村使用药饵，将药物与饲料均匀混合，然后捏成团投放食料台。
⑤注射法。鱼病防治及催产上常采用的注射法有两种，即肌肉注射和腹胸腔注射。此法用药量准确、吸收快、疗效高（药物注射）、预防（疫苗、菌苗注射）效果好等，具有不可比拟的优越性，但操作麻烦，容易损伤鱼体。合适对象是那些数量少又珍贵的种类，或是用于繁殖后代的亲本。治疗细菌性疾病用抗生素类药物，预防病毒病或细菌感染用疫苗、菌苗等。
⑥涂抹法。适用于皮肤溃疡及其它局部感染或外伤。具有用药少、安全、副作用小等优点，但适用范围小。主要用于少量鱼、蛙、鳖等养殖动物以及因操作、长途运输后身体受损伤或亲鱼等体表病灶的处理。
