第三方支付系统以功能可以分成两种形式：
A.单纯的第三方支付（支付通道服务模式）：如银联电子支付、首信易支付等；
B.支付平台账户模式：以支付宝为代表的，具有电子钱包功能，可以进行电子现金的存取，消费帐单的显示。
但事实上无论采用哪种形式，最终都需要通过银行的网上系统来完成支付。
第三方支付系统按独立性也可以分为两种形式：
独立第三方支付：独立的第三支付保持中立，不直接参与商品或服务的买卖，公平、公正地维护参与各方的合法利益，如银联电子支付、易宝支付等。
非独立第三方支付：非独立性的第三方支付依托电子商务平台，如支付宝、财付通等，它们只是作为一种附属品存在于自己的门户网站下。
