微灌系统通常由水源，首部枢纽，输配水管道和灌水器等四部分组成。
（1）水源。河、湖、渠、塘、井、泉等均可作为微灌的水源，但水源水质必须符合微灌对灌溉水质的要求（参见《农田灌溉水质标准》GB5084-92）；而且，无论何种水源都必须通过过滤装置过滤，方可进行灌溉。
（2）首部枢纽。通常由水泵及动力机、控制阀门、过滤装置、施肥装置、测量和保护设备等组成。首部枢纽一般均布置在微灌系统的首部。其中过滤装置和施肥装置以及控制阀门等也可安装在干、支管进入每间设施或各组设施群的首部。
（3）输配水管网。一般分干、支、毛三级管道。干、支管道常埋在地下，可采用UPVC管或PE管。毛管在设施内，可铺设于地面上，也可埋入地面下，视需要和具体情况确定。毛管必须采用PE管，内径一般为10～16mm。
（4）灌水器。有滴头、微喷头、涌水器、滴灌带、滴灌管和多孔管道等多种形式。设施内使用的灌水器一般均放置在地表或悬吊于设施屋架上。灌水器依水流的出流形式不同，有滴水式，漫射式，喷水式或涌泉式等多种类型。
