内生集壶菌在自然条件下主要为害马铃薯，严重威胁马铃薯生产。该病菌主要是通过带病或带菌的种薯或土壤的远距离调运传播，为害马铃薯植株地下部分，侵染茎基部、匍匐茎和块茎，刺激细胞组织增生变成畸形，发病薯块品质变劣不堪食用，冬季储藏也引起腐烂。该病害严重的可导致减产50%以上。
主要防治措施：
（1）严格检疫措施。禁止发生区未经检疫合格的马铃薯调出，病薯和病苗要及时销毁处理。
（2）药剂防治。制种田可用三唑酮等药剂进行喷雾、灌根和毒土覆种进行防治。
（3）农业防治。引进种植抗病品种，采用双行垄作等改进栽培技术，与非感病作物轮作等。
