1.优点：与CT扫描相比较，MRI的优点是：
①多参数成像，除显示解剖形态外，尚可提供病理和生化的信息。
②可获取任何方位包括横断、冠状、矢状和不同倾斜层面的MRI图像，因此其定位和定性诊断比CT扫描更准确。
③血管内血液的"流动效应"，可使血管直接显影。
④无骨骼伪影的干扰。
⑤无X线辐射损伤和碘剂过敏反应之虞。
⑥MRI新技术，如PWI、DWI、MRS、BOLD-fMRI等可在疾病尚未出现形态变化之前，利用功能变化形成图像，以进行疾病的早期诊断或研究某一脑病结构的功能。
2.缺点：
①成像速度较慢，设备的成本和维持费用高。
②骨骼和钙化病变的显像欠佳。
③检查时病人可出现幽闭恐怖症状。
