尽管生态监测还存在着一定的局限性，它在环境监测中的地位和作用仍然是非常重要的。
（1）通过生态监测可揭示和评价各类生态系统在某一时段的环境质量状况，为利用、改善和保护环境指出方向。
（2）由于生态监测更侧重于研究人为干扰与生态环境变化的关系，可使人们搞清哪些活动模式即符合经济规律又符合生态规律，从而为协调人与自然的关系提供科学依据。
（3）通过生态监测还能掌握对生态环境变化构成影响的各种主要干扰因素及每种因素的贡献。这既能为受损生态系统的恢复和重建提高科学依据，也可为制定相应的环保管理计划，增强环保工作的针对性和主动性，进而提高措施的有效性服务。
（4）由于生态监测可反馈各种干扰的综合信息，所以使人们能依此对区域生态环境质量的变化趋势作出科学预测。
