生物医学模式无疑推动了生物医学的发展，但是，将人的生物学方面同心理社会方面隔裂开来，把疾病看作是独立于社会行为的实体，试图仅仅根据躯体过程的紊乱来解释人的心理和行为障碍，反映了心身二元论和机械唯物论观点。
随着时代的发展，生物医学模式的缺陷逐渐暴露。首先，医学的发展已经大大降低了传染病死亡率。目前，心、脑血管病、癌症等多病因疾病成为“疾病谱”和死亡顺位中排在前列的病种。其二，人预期寿命的逐渐提高、生活方式的改变、工作节奏的加快，带来了新的健康和疾病问题。其三，精神病和其它功能性疾病发病率高，单纯的药物治疗效果不尽如人意，因此对医学提出更高的要求。其四，人们对生活质量的要求不断提高，不仅要求没有疾病，同时要求有好的心情，即使在躯体治疗过程中，也要求治疗方案能保证个体一定的生活质量。最后，在医学界内部，越来越多的医生逐渐认识到生物医学模式不能完全解释疾病原因，需要从更广泛的角度认识健康和疾病，将心理社会因素纳入观察范围。同时，医学教育也产生了变化，人文学科，特别是心理学，更多地进入临床教育。心理社会因素对健康和疾病的影响引起人们的重视，促使新的医学模式加速走上医学舞台。
