优点：见效快、效率高、操作简便、不受地区环境条件的限制。
缺点：①药剂、药械和人力的经费开支较大，提高了生产成本。
②杀菌剂的种类较少，而且多数为保护性的药剂，缺乏效率高的内吸性的治疗剂。
③使用内吸杀菌剂容易激发病菌产生耐药性，降低药剂的防治效果。
④化学药剂主要用于防治真菌病害，杀细菌剂种类少，还没有防治病毒病害的化学药剂。
⑤使用选择性的杀菌剂防治某一种主要病害，可能引起另一种次要病害上升为主要病害。
⑥化学药剂使用不当时，不但使植物发生药害，还可能引起人、畜中毒，造成公害、杀伤有益微生物，破坏生态平衡，污染环境。
