二者的区别：
（1）研究对象不同：自然辩证法以科学技术本身为研究对象，自然科学则以天然物或人工物为研究对象。
（2）研究目的的不同：自然辩证法探究科学技术活动中运用什么样的方法研究世界以及这种方法的有效性，探究科学技术究竟在社会生产和社会活动中发生了什么效应以及这种效应的价值。自然科学则通过抽象揭示研究对象如何存在、如何演化、进而对它们进行理论解释和行为预测。
二者的联系：自然辩证法的研究以自然科学的成果为基础，而自然辩证法的研究成果反过来又对自然科学的研究起指导作用，二者相辅相成不可分割。
