(1)肿瘤的早期发现物理仪器检测肿瘤的最低检测限是1cm(10^9个肿瘤细胞)，而生化标志最低检测限为10^8细胞。理论上，利用生化标志能在亚临床期较早地发现肿瘤。目前能用于肿瘤筛查的标志只有两个，前列腺特异抗原(PSA)和甲胎蛋白(AFP)。
(2)肿瘤的鉴别诊断与分期肿瘤标志物常用于鉴别良、恶性肿瘤，且其升高水平常和肿瘤的大小和恶性程度有关，因此定量检测可以有助于临床分期。
(3)肿瘤的疗效监测大部分肿瘤标志物和肿瘤治疗效果相关，标志物的下降程度反映了治疗成功程度。
(4)肿瘤的预后判断有一些标志物专用于观察预后，如乳腺癌的雌激素受体和孕激素受体，类似的还有上皮生长因子受体(EGFR)、癌基因erbB-2编码蛋白。
(5)肿瘤的复发预报术后肿瘤病人应每隔2～3个月测定一次肿瘤标志，至少连续两年，在未再给予治疗时，至少连续二次肿瘤标志物呈直线上升，可认为肿瘤复发。
