（1）类胡萝卜素类化合物，主要是黄、橙、红色，自然界中分布较广，象胡罗卜、番茄和栀子等含有这类色素，其骨架结构为：
（2）黄酮类化合物，以黄、红色调为主，在自然界中分布较广，色素在植物细胞中以配糖体存在，可溶于水。其骨架结构为黄酮。
（3）蒽醌类化合物，其结构中含有蒽醌母体，另有一定数量的羟基或羧基。如大黄、茜草、虫漆、胭脂等。
（4）萘醌类化合物，母体结构为：
（5）苯并吡喃类化合物，色素母体结构带正电荷，颜色随介质的pH值而变化，强酸性下为红色，中性条件下为紫色，碱性下为蓝色。
（6）单宁类化合物，其结构特点为多酚类化合物。
（7）生物碱类化合物，是一类含氮的色素，其结构如下：
（8）其他类天然色素，如藻胆色素、血红素、叶绿素及靛蓝等。
