原理：不同的蛋白质等电点不同，如果分子处于pH和等电点一致的溶液中，则泳动就停止进行。如果溶液内的pH是位置的函数，或者说有一个pH的位置梯度，那么在一个稳定连续的线性pH梯度的溶液（两性载体电解质）中进行分离，每一种被分离的两性物质都移向与它的等电点相一致的pH位置，在那里不再移动（称为聚焦）。由于在这点净电荷（正负抵消）为零，因而又称等电聚焦。
特点：①使用两性载体电解质，在电极之间形成稳定的、连续的、线性的pH梯度。
②由于“聚焦效应”，即使很小的样品也能获得清晰的、鲜明的区带界面③电泳速度快。
④分辨率高。⑤加入样品的位置可任意选择。
⑥可用于测定蛋白质类物质的等电点。
⑦适用于中、大分子量（如蛋白质、肽类、同工酶等）生物组分的分离分析。
