主要是：
（1）名义税率过高，不得不进行较多的税收优惠，导致税负不公平；
（2）生产型增值税不利于推动企业技术进步，提高企业的竞争力；
（3）个人所得税制度没有真正发挥调节收入差距的作用。我国目前的个人所得税实行分类征税制，即分项定率、分项扣除、分项征收。但随着经济的发展和个人收入水平的提高，这种征收制度在实践中暴露出了很多问题。主要是：分项征收不能将纳税人的各项所得综合计算征收，难以体现公平税负、合理负担的基本原则；对不同收入来源采取不同的税率和扣除方法，容易造成纳税人分解收入，多次扣除费用来逃避税收；减免税项目过多，减免税政策不规范、不完善，实际执行中漏洞大，难以监管等；
（4）税收优惠政策过多、过滥，难以体现税制透明的原则。
