（1）α-螺旋：
I.多肽链的主链围绕中心轴有规律的螺旋式上升，螺旋的走向为顺时针方向，即右手螺旋；
I.I：氨基酸侧链伸向螺旋外侧；
I.II：每个肽键的氨基氢和第四个肽键的羰基氧形成氢键，以此类推，肽链中的全部肽键都形成氢键，以稳固α-螺旋结构。
I.V：每3.6个氨基酸残基螺旋上升一周，螺距为0.54nm，所以每个氨基酸残基上升的高度为0.15nm。
（2）β-折叠：
I.多肽链充分伸展，每个肽单元以Ca为旋转点，依次折叠成锯齿结构；
I.I：氨基酸侧链交替地位于锯齿结构的上下方；
I.II：两条以上肽链或一条肽链内的若干肽段平行排列，通过链间羧基氧和氨基氢形成氢键，从而稳固β-折叠结构；
I.V：肽链有顺式平行和反式平行两种。
（3）β-转角：
I.常发生于肽链180·回折时的转角上；
I.I：通常由4个氨基酸残基组成，其第1个残基的羰基氧与第4个残基的氨基氢可形成氢键。
（4）无规卷曲：没有确定规律性的那部分肽链结构。
