1、按研究对象的生物组织水平可分为个体生态学、种群生态学、群落生态学、生态系统生态学、景观生态学、区域生态学和全球生态学;
2、按生物分类类群划分有普通生态学、动物生态学、植物生态学、微生物生态学等;
3、按生境类型划分有陆地生态学和水域生态学等;
4、按研究方法划分有野外生态学、实验生态学和理论生态学等;
5、按生态学与其它科学的交叉划分有生理生态学、分子生态学、数学生态学、化学生态学等;
6、按应用领域划分有农田生态学、农业生态学、渔业生态学、森林生态学、景观生态学、人类生态学、生态伦理学等。