1.DNA的双螺旋结构为反向平行的双螺旋结构
①DNA分子由两条多核苷酸链组成，以中心为轴，形成右手双螺旋。
②两条链反向平行，即两条链的方向相反。两条单链间以氢键相连。每一单链具有5’-3’极性。
③糖-磷酸键是在双螺旋的外侧，碱基对与轴线垂直。
④糖与附着在糖上的碱基近于垂直。
⑤碱基配对时，必须一个是嘌呤，另一个是嘧啶。
⑥DNA双螺旋有大沟（major or wide groov）和小沟（minor or narrow groov ）的存在。大沟（2.2nm），小沟（1.2nm）。
2.碱基顶部基团裸露在DNA大沟内。
3.蛋白质因子与DNA的特异结合依赖于氨基酸与DNA间的氢键的形成。
4.蛋白质因子沿大沟与DNA形成专一性的结合，其结合的机率与多样性高于沿小沟的结合。
5.大沟的空间更有利于与蛋白质的结合。
