遇有降雨天气，重点防洪地段1小时降雨量达到45mm及以上时，列车限速120km/h；1小时降雨量达到60mm及以上时，列车限速45km/h。当1小时降雨量降至20mm及以下，且持续30分钟以上，可解除限速。沿线雨量信息由防灾安全监控系统提供，当降雨量超标时，由列车调度员根据防灾安全监控系统报警提示发布限速调度命令。
动车组列车运行中，司机发现积水高于轨面时，应立即停车，并报告列车调度员，确认水面位臵，当积水未超过轨面100mm时，司机以随时能够停车速度（最高不超过20km/h）通过积水地段。列车调度员立即通知已进入区间的后续列车停车（避免停车隧道内），并禁止向该区间放行列车。列车停车位臵的积水超过轨面100mm时，司机应按随车机械师要求降弓，停车供电，并向列车调度员报告，请求救援。
