1.热原质（致热源），是细菌合成的一种注入人体或动物体内能引起发热反应的物质。产生热致源的细菌大都为格兰阴性菌，热致源即其细胞壁的脂多糖。
2.毒素及侵袭性酶：
①外毒素：多数G+菌和少数G-菌在生长繁殖过程中释放菌体外的蛋白质；
②内毒素：G-菌细胞壁的脂多糖；外毒素毒性强于内毒素。
③侵袭性酶：某些细菌产生的，能损伤机体组织，促使菌体的侵袭和扩散，是细菌重要的致病物质。
3.色素：由某些细菌产生的，含不同颜色，有助于进行细菌鉴别，分为水溶性和脂溶性两类。
4.抗生素：某些微生物代谢过程中产生的一类能抑制或杀死某些其他微生物或肿瘤细胞的物质。抗生素大多由放线菌和真菌产生。
5.细菌素：某些菌株产生的一类具有抗菌作用的蛋白质。细菌素仅对与产生菌有亲缘关系的细菌有杀伤作用。
6.维生素：由细菌合成，供自身需要，也可分泌到周围环境。
