湖泊可以从以下几方面进行分类：
1）含盐度：有两种划分方案：其一，含盐度＞3.5%为咸水湖泊；含盐度＜3.5%为淡水湖泊。其二：含盐度＜0.1%为淡水湖，含盐度为0.1~1%为微咸水湖，含盐度为1~3.5%为咸水湖，含盐度＞3.5%为盐湖。
2）沉积物特征：分为碎屑沉积湖泊，以陆源碎屑沉积为主；化学沉积湖泊以化学岩沉积为主。二者之间常有许多过渡类型。
3）地理位置：可分为近海湖泊和内陆湖泊
4）成因：可分为构造湖（断陷湖、坳陷湖），河成湖（如鄱阳湖，洞庭湖）、火山湖（如长白山的天池），岩溶湖和冰川湖等。
5）库卡尔等根据干旱程度，地理环境，沉积物类型及其供应的充分程度，首先划分出永久性（稳定性）湖泊和暂时性（间歇性）湖泊。永久性湖泊进一步划分为陆源碎屑沉积型，化学沉积型、生物沉积型，湖沼沉积型等四种类型。暂时性湖泊又可进一步划分为干盐湖沉积型和盐沼沉积型两类。
