（1）氧化还原与Eh灌水前，Eh（氧化不原电位）一般为450～650mV，灌水后可迅速降至200mV以下，尤其土壤中有机质旺盛分解期，Eh可降至100～200mV，水稻成熟后落干，Eh又可上升到400mV以上。同一水稻土剖面中，由于各土层的微环境不一样，其Eh也不一样。水稻土表面极薄（几毫米至1cm）的泥层与淹水相接，受灌溉水中溶解氧（每升水中含氧7.9mg）的影响，呈氧化状态，Eh为300～650mV；其下耕作层和犁底层，由于水饱和，加之微生物活动对氧的消耗，Eh可降至200mV以下，为还原层。犁底层以下土层的Eh值则取决于地下水位深度，故又处氧化状态，Eh可达400mV以上；如地下水位高，则该底层处于还原状态。水稻土的这种Eh特征就决定了水稻土的形成及有关的一系列特征。水稻淹水后各层次的氧化还原状态如图3所示。
（2）有机质的合成与分解与母土（不包括有机土）相比，水稻土有利于有机质积累，故有机质含量增加，但畗酸比重大。
（3）盐基淋溶与复盐基作用种稻后土壤交换性盐基将重新分配，一般饱和性土壤盐基将淋溶，而非饱和土壤则发生复盐基作用，特别是酸性土壤施用石灰以后。
（4）铁、锰的淋溶与淀积在还原条件下，低价的铁、锰开始大量增加，特别与突然那个有机质产生络合而下移，于淀积层开始淀积（形成水耕淀积层），而且锰的淀积深度低于铁。一般铁、锰在耕作层低，淀积层高，潜育层最低。铁、锰的淋浴可以导致“白化土”作用的发展，这方面可参考有关铁解作用的学说。
（5）黏土矿物的分解与合成水稻土的黏土矿物一般同于母土，但含钾矿物较高的母土（如石灰性紫色土）发育的水稻土，则水云母含量低，而蛭石增加。
