（1）系统育种法。系统育种法是利用多基因抗性的主要方法.特别是在缺乏抗源时，从大群体中选择抗病虫单株是寻找抗源的主要途径。
（2）杂交育种法。杂交育种法是在抗病虫育种工作中最有效的方法之一，在亲本选择方面应注意以下几个问题：
第一，利用垂直抗病性的抗源材料做亲本时，一般力求选用抗病程度高的抗源材料；
第二，应选用抗病性稳定的材料做抗病亲本。
第三，在选用抗病亲本时，尽可能选用既抗病，品质又较好的品种或品系作为亲本材料
第四，利用多基因抗性的材料做亲本时，最好选择两个亲本都具有一定程度的抗病性，这样有利于在杂种后代中选出抗病性。
（3）回交法。在烟草的抗病虫育种中，无论是种间杂交转移抗性基因，或是在普通烟草种内杂交选育抗病虫品种，回交法的应用都很普遍。
