当前农作物抗病育种存在的主要问题及改进措施。

（1）抗病品种在推广使用过程中因机械混杂、天然杂交、突变以及遗传分离诸多原因会出现感病植株，多年积累后可能导致品种退化、因而必须加强良种繁育制度，保持种子纯度。在抗病品种群体中及时拔除杂株、劣株和病株，选留优良抗病单株，搞好品种提纯复壮。
（2）当前所应用的抗病品种多数仅具有小种专化抗病性，推广应用后，就可能使病原菌群体中能够侵染该抗病品种的毒性菌株得以保存和发展起来，成为稀有小种。抗病品种推广的面积越大，这些稀有小种积累的速度也越快，逐渐在病原菌群体中占据数量优势，成为优势小种，此时抗病品种就逐渐丧失抗病性，成为感病品种，这种抗病性“丧失”现象，是抗病品种应用中最重要的问题。小麦的抗锈品种、抗白粉病品种，水稻的抗病品种，马铃薯的抗晚疫病品种等抗病性迅速丧失现象尤为严重。除少数品种抗病性可维持较长时间外，一般应用5年左右就会丧失其抗病性，不得不被淘汰。
（3）为了克服或延缓品种抗病性的丧失，延长品种使用年限，除了在育种时尽量应用多种类型的抗病性和使用抗病基因不同的优良抗源，改变抗病性遗传基础贫乏而单一的局面以外，最重要的是搞好抗病品种的合理布局，在病害的不同流行区采用具有不同抗病基因的品种，在同一个流行区内也要搭配使用多个抗病品种。
（4）此外，有计划地轮换使用具有不同抗病基因的抗病品种，选育和应用具有多个不同主效基因的聚合品种或多系品种等也是可行的措施。合理使用抗病品种可以充分发挥其抗病性的遗传潜能，防止品种退化，推迟抗病性丧失现象的发生，延长抗病品种的使用年限。
（5）研究与推广适宜的栽培方法，使“良种”与“良法”配套，是保证植物正常生长发育，充分表达其抗病性的基本途径。在诸多健身栽培措施中，水肥管理是中心，必须研究抗病品种的需肥需水规律，制定合理的施肥、灌水方案。

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