三年三圃制经过选株（穗）、选行和选系3次选择，最后混系繁殖，即株（穗）行圃、株（穗）系圃、原种圃的三年三圃制繁育原种。1、单株（穗）选择：单株（穗）选择是原种生产的基础，可以在同品种的原种圃、决选的株（穗）系圃、种子繁殖田或专门设置的稀条播种植的选择圃里进行单株（穗）选择。
2、株（穗）行圃：经室内考种入选的单株（穗）的种子在同一条件下按单株（穗）分行种植种成株（穗）行圃。
3、株（穗）系圃：经室内考种当选的株（穗）行种子，按株（穗）行分别种植，建立株（穗）系圃。当选株（穗）系分区核产，产量不应低于邻近对照。对田间入选的株（穗）系材料和对照，分别脱粒、称重，取样进行考种，考察粒型、粒色、籽粒饱满度和粒质4个项目，须从严掌握，并增加千粒重和容重的测定，最后进行综合评价，决定取舍。
4、原种圃：将上年当选株（穗）系的种子混合稀播于原种圃，进行扩大繁殖。分别在抽穗期和成熟期进行纯度鉴定，严格去除杂株、弱株，并携出田外，收获的种子即为原种。
