（1）复杂性。评估的复杂性决定了公共部门绩效评估系统功能分析的复杂性。另外，绩效评估系统功能分析所涉及的目标多样性、产品的无形性以及其所涉及的范围之广、支撑理论体系之零散，导致系统功能的进一步复杂性。
（2）动态性。一方面，公共部门绩效评估系统功能分析是一个不断上升的螺旋式或波浪式的运动过程；另一方面，绩效评估功能分析是一个主客体互动的过程，如绩效申诉。
（3）差异性。中西对公共部门界定、评估功能分析的主体、影响因素、评估对象等有所不同；另一方面，即使是同一国家、不同的部门行业或地区所涉及的领域、范围也不同。
（4）变异性。环境因素的变异直接或间接地影响着行政系统的变化与变革。尤其是面临着当今信息化的浪潮，电子政务的兴起，绩效信息不断更新，公共部门绩效评估也必须随之变化。
