(1)皮肤粘膜损害：发生率70%～80%，粘膜损害主要表现为口腔溃疡。皮肤可出现多种皮损，常见的有面部蝶形红斑、DLE样皮损、皮肤血管炎、脱发等，还可出现雷诺现象、大疱性皮损、荨麻疹样血管炎、网状青斑等。
(2)关节肌肉损害：关节受累最常见，90%以上患者出现不同程度的关节痛，可伴关节红肿，但关节畸形不多见。肌炎和肌痛也较常见，但肌无力不明显。少数患者可出现缺血性骨坏死，以股骨头受累最常见。
(3)肾损害：即狼疮性肾炎，发生率约75%，其严重程度与疾病预后关系密切。其表现类似肾炎和肾病综合征，早期主要表现为蛋白尿和(或)血尿，肾功能一般正常，随着病情发展，后期可出现尿毒症，是SLE的主要死因。
(4)心血管系统损害：发生率为70%，以心包炎最为多见，一般表现为干性纤维性心包炎，也可出现心肌炎、心内膜炎、动脉炎、静脉炎等，部分患者可有周围血管病变。
(5)呼吸系统损害：发生率为50%～70%，以胸膜炎多见，常为双侧，多为干性，还可发生间质性肺炎或肺间质纤维化。
(6)神经系统损害：常在急性期或终末期出现，表现呈多样化，如偏头痛、记忆力减退、精神异常(如躁动、幻觉、妄想及强迫观念等)、脑膜炎、脑炎、偏瘫、失语及癫痫样抽搐等，其中癫痫样抽搐是狼疮性脑病的典型表现；亦可出现脊髓损害和周围神经损害。
(7)消化系统损害：可表现恶心、呕吐、腹痛、腹泻等消化道症状，肝受累时还可有肝肿大、肝功能异常等自身免疫性肝病的表现。
(8)血液系统损害：白细胞减少最常见，其次为血小板减少，也可发生溶血性贫血。
(9)还可累及眼部出现眼底中心血管周围丝棉样白斑、视乳头水肿等变化；也可出现淋巴结肿大、口干、眼干等症状。
