在设备运行过程中，随着过滤时间的延续，滤层不断截留悬浮物杂质，滤料层水头损失逐渐增大，促使虹吸上升管中水位不断升高。当水位上升到虹吸辅助管的管口时，水从辅助管流下，依靠下降水流在管中形成的真空和水流的挟气作用，抽气管不断将虹吸管中空气抽出，使虹吸管中真空度逐渐增大。其结果，一方面虹吸上升管中的水位升高。同时，虹吸下降管将排水水封井中的水吸上至一定高度。当上升管中的水越过虹吸管顶端而下降时，管中真空度急剧增加，达到一定程度时，下降水流与下降管中上升水柱汇成一股；中出管口，把管中残留空气全部带走，形成连续虹吸水流。这时，由于滤层上部压力骤降，促使滤后水水箱和另一个过滤罐滤后水水箱中的水通过橡胶挠性连通管、清混水连通管循着过滤时的相反方向进入虹吸管，从而滤料层从下而上受到反冲洗。冲洗废水由排水水封井经过反洗排水管进入下水道。
在冲洗过程中，冲洗水箱内水位逐渐下降。当水位下降到虹吸破坏斗时，虹吸破坏管管口与大气相通，虹吸现象被破坏，过滤器反洗结束，然后进入下一周期的运行，过滤重新开始。
反冲洗过程中，来水依然经过分配堰、U型进水管进入过滤器中，跟反冲洗废水水流汇集经过虹吸管排入排水筒。
