（1）市场导向原则。农村产业结构调整应该以市场为导向，政府转变职能，作好引导和服务工作。
（2）协调发展原则。农村产业结构的调整是一个循序渐进协调发展的过程，协调主要是结构的比例趋向合理的发展。
（3）因地制宜原则。因地制宜的内容包括因自然资源、因经济技术条件等方面，发展适合本地情况的农村产业结构，发展适合当地条件的特色产业，就是因地制宜。
（4）保护生态原则。农村产业结构的调整必须考虑对农村的自然生态环境的影响。盲目上项目而破坏资源将贻害未来。如忽视森林资源的保护，滥砍滥伐，毁林开荒，草场退化，沙化，水资源的浪费和污染等问题应该得到很好的解决。
（5）效益最佳原则。农村产业结构的调整过程，也要与增长方式的转变结合起来，要由粗放型转向集约型，要重视劳动密集性产业的发展，以增加劳动力就业机会，既有经济效益又产生社会效益。效益最佳的标志就是经济效益、社会效益和生态效益的完美统一。
