（1）GDP不能反映经济发展过程中对资源和环境造成的负面影响。任何一个国家在发展经济的过程中都需要消耗一定的自然资源，并影响到生态环境。这是发展经济过程中必然要付出的代价。然而，GDP指标却只反映了经济发展的相关情况，而忽视了资源损耗及环境破坏所带来的损失。比如，砍伐森林会带来就业的增加扩大生产等经济效果，从而GDP就会增加，但过量采伐后森林资源的减少及生态环境的破坏这些负面影响却没有计算在GDP中。更有甚者，把为治理这些环境污染所进行的活动，在国民经济核算中也被作为一般经济活动对待，同样的计算产出，汇总到GDP中。因此，GDP指标只核算了经济发展积极的一面，而没有核算对资源环境造成损害的消极一面，从某种程度上高估了当期经济活动创造的价值。
（2）GDP指标不能准确地反映一个国家社会财富的增长。一个国家社会财富中很重要的一个组成部分就是固定资本存量。因此，一个国家的社会财富能否有效地增长，就取决于固定资本存量是否能有效的增长，这就不仅取决于其总额的大小，更取决于其质量。如果固定资本的质量不好，没有被充分使用或者未达到使用期限就不能继续使用，那么固定资本形成总额再多也不能有效地提高一国的社会财富。但是GDP指标只能反映固定资本形成总额的大小，而不能描述其质量，因而GDP指标不能准确地反映一个国家社会财富的总积累。
（3）GDP指标的统计核算存在较大偏差。GDP仅以是否有交易行为的发生，相应的是否产生市场价格作为GDP核算的依据和范围。这样一来，那些虽然属于经济意义上的生产性活动，例如家庭劳动或者一些非法的或地下经济活动，但是由于没有涉及到交易行为或者没有产生市场价格的非市场经济活动就被排除在GDP指标的统计核算范围之外。
这些非市场经济活动主要包括以下方面：
1.自给性服务产品的价值。GDP核算中未包括家庭和个人为自己的最终消费而产生的自我服务。例如，自己做家务、抚养孩子、照顾老人等。如果这些自我服务未纳入GDP核算范围内，那么它反映的就不是全部的社会劳动成果；
2.义务劳动的生产成果。义务性劳动包括义务植树、义务照顾老人等。这些劳动是没有报酬的，因此也未计入GDP，这样也会使GDP反映的生产成果不完全；
3.不正规经济的生产活动成果。不正规经济又称地下经济、隐蔽经济或未被观察经济，这些活动是未经工商部门登记、没有纳税的生产与经营活动，很难准确统计。GDP中如果不包括这部分生产成果，是不完整的，不仅低算了生产总量，还会影响经济分析和决策。
（4）GDP指标并不能全面反映经济增长的质量。一般认为，国民经济增长的高质量具体表现在六个方面，即国民经济持续、稳定增长；经济增长方式优化；经济结构优化；居民收入增加、生活质量提高、收入差距适度且社会安定；环境质量改善，并非生态环境恶化；本国国际竞争力增强，不使本国经济依附于外国。GDP指标能够较好地说明国民经济增长的前面三个方面的质量情况。正如前文所论述到的，从GDP及其增长率构成的时间序列可以观察到国民经济增长的稳定性；用社会劳动生产率（GDP与从业人员人数之比）和投资效果系数（GDP与投资总额之比）等指标构成的时间序列来反映经济增长方式是否优化；用各产业部门增加值占全国GDP总量的比重指标构成的时间序列，可以反映各个时期产业结构的状态以及其发生的变化对比。但是，在描述国民经济增长的后三个表现方面的质量情况上是没有实质性作用的。这就说明，GDP指标并不能全面地反映经济增长的质量，而只能是部分地反映国民经济的增长质量。
GDP指标是经济合理性与局限性并存的，但是我们不能因为这些局限性而将GDP全盘否认，没有任何一个指标是万能的，不论是优点还是缺陷，我们都要谨慎地看待。一方面GDP作为国民经济核算体系中的核心指标，我们要充分发挥它的作用；另一方面我们也应该清楚地认识到GDP本身是具有一定缺陷的，它不是万能的，因此应该学会合理使用，不断发展和完善这一重要指标。
