棉花期货实行集中交割，采用三日交割法：
（1）最后交易日（即配对日）闭市后，同一交易编码的投资者所持有的该交割月买卖持仓相对应部分由计算机自动平仓，平仓价按当日结算价计算。其他未平仓合约，一律视为交割合约，由计算机按数量取整、时间优先原则予以配对。
（2）最后交易日后的第一个交易日（即通知日），买卖双方到交易所结算部签领《交割通知单》。
（3）最后交易日后的第二个交易日（即交割日）上午9时之前，买方会员应当将尚欠货款划入交易所帐户，卖方会员应当将《标准仓单持有凭证》交到交易所结算部。买卖双方应当在规定时间到交易所结算部办理具体交割及结算手续，同时，买方会员把投资者名称和税务登记证号等事项提供给卖方会员。交割日，交易所收取买方会员全额货款，并于当日将全额货款的80％划转给卖方会员，同时将卖方会员仓单交付买方会员。余款在买方会员确认收到卖方会员转交的增值税专用发票时结清。发票的传递、余款的结算，会员均应当盖章和签字确认。
