1、两者的范围和重要性程度不同。指令性计划指标规定的产品、项目和经济活动，一般地说，要比指导性计划指标重要得多；
2、两者的法律效力和保证手段不同。指令性计划指标是具有“法令”效力的必须执行的计划指标，违者要负法律责任。指导性计划指标不是靠国家强制力贯彻的，国家主要运用经济杠杆促其实现，有关执行单位可以适当变通，合理安排；
3、两者的管辖关系不同。指令性指标由国务院管理，其目录由国家发展改革委员会（原国家计委）会同各省、自治区、直辖市和各部、委共同研究提出，报国务院决定、下达，省级人民政府也可增列少量指令性计划指标，报国务院批准执行。指导性计划指标则按照“分级管理”原则，分别由国务院、省级人民政府或它们的授权机关提出。
