原位杂交（ISH）是核酸分子杂交的一部分，是将组织化学与分子生物学技术相结合起来检测和定位核酸的技术。
原位杂交可应用于：
1.细胞特异性mRNA转录的定位可用于基因图谱、基因表达和基因组进化的研究。
2.感染组织中病毒DNA/RNA的检测和定位，如EB病毒mRNA、人类乳头状瘤病毒和巨细胞病毒DNA的检测。
3.癌基因、抑癌基因及各种功能基因在转录水平的表达及其变化的检测。
4.基因在染色体上的定位。
5.检测染色体的变化，如染色体数量异常和染色体易位等。
6.分裂间期细胞遗传学的研究，如遗传病的产前诊断和某些遗传病基因携带者的确定，某些肿瘤的诊断和生物学剂量测定等。
