疟病与伤寒少阳病在主症上都有寒热往来、脉弦。但二者在具体病因、症状、病机、治法方面都有区别。疟病的病因为感受疟邪，其症状特点是寒热往来，休作有时，发作时先寒后热，继之汗出热退。病机为邪伏少阳，出入于营卫之间，疟邪与卫气相集，邪正相争则病发，邪入与营阴相争则寒，出与卫阳相搏则热，邪与卫气相离则汗出热退而发作停止。人体营卫运行，日夜有度，故其寒热往来，休作有时。治疗在和解截疟的基础上，根据具体病情可分别采用汗、吐、下、温、清、针刺、饮食调理等法。
伤寒少阳病多因太阳病外邪不解，传变而来。症状特点是寒热往来，作无定时，伴胸胁苦满，不欲饮食，口苦，目眩等。证属无形邪热停留在少阳半表半里，正邪分争，互有胜负，故寒热往来，作无定时。少阳胆气不舒，则胸胁苦满，不欲饮食，口苦，目眩。治疗以和解为大法，因邪气既不在太阳之表，也不在阳明之里，故禁用汗、吐、下之法。
