肾移植排斥反应的病理诊断的主要线索是肾血管变化，血管内皮细胞（靶组织）的免疫反应损害是移植排异反应的始动环节。
1.在超急排异反应时血管以变性坏死为主，急性以渗出为主，慢性则以增生性变化为主。
2.超急排异反应的肾小动脉内皮细胞肿胀、空泡变性和脱落、管腔内纤维素析出、中性白细胞靠壁集聚和渗出浸润，是病理诊断的主要依据。
3.急性排异反应动脉的纤维素样坏死、内膜的炎性渗出和泡沫状细胞形成、间质明显水肿和淋巴细胞为主的炎性浸润，为诊断要点。
4.慢性排异反应，则以动脉内膜平滑肌细胞和纤维母细胞增生和纤维化、肾小球和肾小管的萎缩硬化以及间质纤维化为诊断依据
