辩证思维方法是唯物辩证法在思维过程中的运用，包括分析与综合、归纳与演绎、从抽象到具体、逻辑与历史一致。现代科学思维方法是一个适应现代实践活动和现代科学发展而建立起来的方法群。主要包括控制方法、信息方法、系统方法、结构方法、模型化方法和理想方法等。同时，还有一些适应于人文社会科学研究的发生学方法、解释学方法、符号学方法、传播学方法等等。
辩证思维方法与现代科学思维方法属于不同层次的方法系列，二者功能和角度不同。辩证思维方法从普遍联系和永恒发展的角度来揭示事物，侧重于整体把握。现代科学思维方法在确认客观世界的存在及其普遍联系和永恒发展的前提下，从某些方面研究世界。
辩证思维方法与现代科学思维方法又是统一的。一方面，辩证思维方法是现代科学的思维方法的方法论前提，辩证思维的基本精神和原则贯穿于现代科学思维之中。另一方面，现代科学思维方法又丰富和深化了辩证思维方法。现代科学思维方法使辩证思维方法能更精确地确定事物相互关系的范围、层次、性质和存在方式，从而能更深刻、更具体地把握事物的本质和规律。
