昆虫消化系统由前肠、中肠、后肠以及与消化与关的唾腺组成。
前肠具有摄取、磨碎和暂时贮藏食物的功能。包括咽喉、食道、嗉囊、前胃。咽喉在咀嚼式口器中仅是食物的通道，但在刺吸式口器昆虫中，咽喉上附着的强大扩肌特化成咽喉唧筒，吸食时，与食窦唧筒交替伸缩将血液抽吸入食道；食道仅是食物的通道；嗉囊是暂时贮藏食物的场所；前胃除有磨碎食物的功能外，还可以作为调节食物进入中肠的活瓣并兼有过滤的作用。
中肠又叫“胃”，是分泌各种消化酶、消化食物及吸收营养物质的主要部位。中肠中胃盲囊主要功能是增加中肠表面积，有利于分泌消化酶和吸收营养物质，此外还有扩大容积和滞留共生物作用；围食膜有保护中肠细胞免受食物和微生物损害的作用，并有显著的选择性穿透功能。
后肠除了排除食物残渣和代谢废物外，还有吸回水分和无机盐类、调节血液渗透压和离子平衡的功能。后肠分为回肠、结肠和直肠。其中，回肠与直肠之间的直肠瓣可调节残渣进入直肠；许多昆虫的直肠常特化为直肠垫，主要功能是吸回残渣中的水分和无机盐。
唾腺的主要功能是润滑口器、溶解食物和分泌消化酶。
