一、生物标志：
1、指相化石——能够反映某种特定环境条件的化石
2、形态功能分析法：深入地研究化石的基本构造，力求阐明这些构造的功能，并据此重塑古代生物的生活方式3、群落古生态分析法：根据群落的生态组合类型来分析古环境，并根据不同生态类型的群落在纵向上的演替来分析推断古环境的演化过程。
二、物理标志：主要包括岩石的颜色、结构、沉积构造等。颜色：浅色岩石含有机质低，多形成于浅水、动荡和氧化条件下，暗色岩石形成于深水或静水和还原条件下。沉积物结构：一般来说粒度、圆度高，分选好，颗粒支撑的岩石反映较高能量的沉积条件，反之则反映较低能的水环境。原生沉积构造：波痕是流水、波浪或风作用于非黏性沉积物表面留下的波状起伏的痕迹。
冲刷痕和刻压痕是重力流沉积中常见的沉积构造。暴露构造通常反映沉积盆地边缘间歇性暴露条件，平行层理是高流态条件下的沉积，水平层理反映静水条件。板状交错层理是在流水作用下形成，楔状交错层理形成于冲洗作用，进退潮流作用形成鱼骨状交错层理。块状层理反映未经分选的沉积物经快速堆积形成，均质层理反映单一成分的快速堆积或生物扰动破坏原生层理所致。粒序递变层理一般认为由牵引流作用形成，粗尾递变一般认为由重力流作用形成。准同生变形构造发育于快速堆积或具有原始倾斜的沉积层中。鸟眼构造形成于潮坪环境古代叠层石主要形成于潮坪等浅水沉积条件。
三、岩矿标志：
1、沉积物的结构组份可以反映其沉积历史、物源及沉积介质的特征。如纯净石英砂岩形成水浅高能条件，鲕状灰岩形成于水质清洁的动荡的浅水环境
2、自生矿物指沉积期货同声期形成的原生矿物，他们通常是沉积介质物化条件的反映，如海绿石、磷灰石主要形成于浅海成绩环境。四、其他标志：沉积相的纵向变化序列，横向变化关系及沉积体的空间几何形态在沉积相恢复中亦可发挥重要作用。
