影响氧化磷酸化的因素包括：抑制剂、ADP的调节作用、甲状腺激素、线粒体DNA突变等。
（1）抑制剂：a.呼吸链抑制剂能阻断呼吸链中某些部位电子传递；b.解偶联剂使氧化与磷酸化偶联过程脱离；c.氧化磷酸化抑制剂对电子传递及ADP磷酸化均有抑制作用。
（2）ADP的调节作用：正常机体氧化磷酸化的速率主要受ADP的调节。当机体利用ATP增多，ADP浓度升高，转运入线粒体后使氧化磷酸化速度加快；反之ADP不足，使氧化磷酸化速度减慢。这种调节作用可使ATP的生成速度适应生理需要。
（3）甲状腺激素：诱导细胞膜上Na+-K+-ATP酶的生成，使ATP加速分解为ADP和Pi，ADP增多促进氧化磷酸化，甲状腺激素（T3）还可使解偶联蛋白基因表达增加，因而引起耗氧和产热均增加。
（4）线粒体DNA突变：可影响氧化磷酸化功能，使ATP生成减少而致病。
