区别有：
（1）评估的角度不同。财务评价是站在企业的角度考察项目的盈利能力及借款偿还能力，而国民经济评价是从国民经济和社会需要出发考察项目需要社会付出的代价和对社会的贡献。
（2）效益与费用的构成及范围不同。在效益与费用界定中，凡是对目标贡献的就是收益，凡是为实现目标付出的代价就是费用。企业目标是盈利，社会目标是通过资源的有效配置和福利的公平分配促进整个经济的可持续发展，因此有些在财务评价中划为支出的，在国民经济评价中未必属于支出（如税金）；而在财务分析中一些不作为支出的，则在国民经济评价中应作为支出（如污染）。
（3）采用的参数不同。财务评价采用现行市场价格，国民经济评价采用根据机会成本和供求关系确定的影子价格；财务评价采用基准收益率，而国民经济评价采用社会折现率；财务评价彩国家统一规定的官方汇率，而国民经济评价采用影子汇率。
（4）评估的方法不同。企业财务评价采用盈利分析法，而国民经济评价采用费用效益分析、多目标综合分析等方法。
