1.在激励薪酬计划中所使用的产出标准很可能无法保证足够的标准和公正，在产出不公平的情况下，激励薪酬计划可能流于形式。
2.激励薪酬计划有可能导致员工之间或者员工群体之间的竞争，而这种竞争不利于组织的总体利益。
3.在激励薪酬的计划的执行和执行过程中，还有可能增加管理层和员工之间产生摩擦的可能，因为在整个计划中存在讨价还价的问题
4.激励薪酬计划实际上是一种工作加速器，有时员工收入的增加会导致企业出台更为苛刻的产出标准，这样会破坏企业和员工之间的心灵契约。
5.激励薪酬公式有时非常复杂，员工可能难以理解。
