1.温度对微生物细胞生长的影响温度升高，酶促反应速度加快，呼吸强度加大，细胞的生长繁殖加快；同时，随温度升高，酶失活的速度也加快，菌体衰老提前，发酵周期缩短，不利于发酵生产。
大多数的微生物在20-40℃范围内生长；嗜冷的微生物在温度低于20℃下生长快速；
嗜中温微生物在20-35℃生长良好；而嗜热微生物在50℃以上生长良好。
当培养温度低于最适生长温度时，每提高10℃生长速率大致增长1倍；当温度超过最适生长温度，生长速率随温度增加而迅速下降。
2.温度对产物形成的影响
以青霉菌的生长为例，青霉素的形成速率对温度十分敏感，产物对温度的敏感性以及产物合成生化反应催化酶对温度的敏感性。
温度会影响生物合成方向，如四环素发酵中金色链霉菌同时能产生金霉素，在温度低于30℃下，合成金霉素的能力较强；合成四环素的能力随温度的升高而增大，在35℃下只合成四环素。
温度对代谢由调节作用，当温度低于20℃，氨基酸合成途径的终产物对第一个酶的反馈抑制作用比在正常生长温度37℃是更大。所以可以考虑在抗生素发酵后期降低发酵温度，让蛋白质和核酸的正常合成途径关闭早一些，从而使发酵代谢转向产物合成。
3.温度对发酵液物理性质的影响
温度对氧的溶解度影响大，温度升高，氧的溶解度下降；
温度影响基质的分解吸收速率。
